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Plasma-SeqSensei™ Non-Small Cell Lung Cancer RUO Kit

Das Plasma-SeqSensei™ (PSS) NSCLC RUO (research use only) Kit erkennt Mutationen zirkulierender Tumor-DNA (ctDNA) im Plasma von Patienten mit einem nicht-kleinzelligem Lungenkarzinom (Non small cell lung cancer = NSCLC).

Das Kit verwendet Next-Generation-Sequenzierungstechnologie für die Erkennung und Identifizierung von Mutationen BRAF, EGFR, KRAS und PIK3CA in menschlicher ctDNA aus Blutplasma.  Diese Gene tragen signifikant zur Entstehung von nicht-kleinzelligem Lungenkrebs bei und sind wichtige Biomarker für die Prognose, Therapiewahl und das Monitoring von Rezidiven und Therapieansprechen. [1] [2]

EGFR-Mutationen (in Exons 18-21), welche die interne Rezeptor-Tyrosinkinase-Domäne kodieren haben eine variierende Fähigkeit, die Tyrosinkinase auch in Abwesenheit von Liganden zu aktivieren. EGFR-Mutationen werden in 10-15% der Adenokarzinome der kaukasischen Bevölkerung  beobachtet (unabhängig von Raucherstatus) und in 40-60% der Adenokarzinome der ostasiatischen Bevölkerung. [3]

BRAF-Mutationen sind die Treiber-Onkogene in 1-3% der NSCLC-Fälle (klassische V600E-Mutation (50%)). [4]

KRAS-Mutationen treten in ca. 30% aller Adenokarzinome der Lunge auf (KRAS G12C stellt dabei ~44% aller KRAS-Mutationen und damit ~13% aller Fälle von Lungen-Adenokarzinom). [5]

PIK3CA-Mutationen wurden bei 2-7% der NSCLC-Fälle gefunden (in Exon 9 und Exon 20). [6]

Für die Konfiguration des Plasma-SeqSensei™ NSCLC RUO (research use only) Kits wurden basierend auf den angegebenen Mutationsfrequenzen in den Datenbanken COSMIC (Catalogue of Somatic Mutation in Cancer) und cBioPortal for Cancer Genomics diese vier Gene als wichtige Schlüssel-Onkogene ausgewählt.

Features

Die Mutationshäufigkeiten sind in der Tabelle unten aufgeführt:

Lungenkrebs

  COSMIC [7] cBioPortal [8]
BRAF 2.2% 6.0%
EGFR 26.5% 16.0%
KRAS 15.9% 22.0%
PIK3CA 2.8% 8.0%

 

Häufigste Mutationen, die mit dem Plasma-SeqSensei™ NSCLC RUO-Panel erkannt wurden:

Gene Häufigste Mutationen bei NSCLC
BRAF V600E
KRAS G12C, G12V, G12D, G12A, G13D, G13C, G12S, G12R, G12F, Q61H
PIK3CA E545K, E542K, H1047R, H1047L
EGFR L858R, E746_A750del, T790M, L747_P753delinsS, L747_T751del, L747_A750delinsP, L861Q

Das Plasma-SeqSensei RUO Kit™ ist nur für Forschungszwecke bestimmt. Eine diagnostische Verwendung wird nicht unterstützt.

 

Referenzen

  1. Chae et al. Detection of Minimal Residual Disease Using ctDNA in Lung Cancer: Current Evidence and Future Directions. Journal of Thoracic Oncology 14(1), 16-24, 2018.
  2. Schwartzberg et al. Liquid biopsy mutation panel for non-small cell lung cancer: analytical validation and clinical concordance. Precision Oncology 4(15), 1-7, 2020.
  3. ESMO. EGFR IN LUNG CANCER: ESMO BIOMARKER FACTSHEET. 2015.
  4. Lee et al. Precision treatment for metastatic non–small cell lung cancer: A conceptual overview. CLEVELAND CLINIC JOURNAL OF MEDICINE 88(2), 117-127, 2021.
  5. Veluswamy et al. KRAS G12C-mutant non-small-cell lung cancer: biology, developmental therapeutics, and molecular testing. The Journal of Molecular Diagnostics, 2021.
  6. Wang et al. Clinical Significance of PIK3CA Gene in Non-Small-Cell Lung Cancer: A Systematic Review and Meta-Analysis. BioMed Research International, 1-9, 2020.
  7. https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic
  8. https://www.cbioportal.org/
Kontakt

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+43 1 486 16 31

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